tomcat/bin/service.bat
这个文件就是将tomcat安装为系统服务的，参数为
Usage: service.bat install/remove [service_name]
install 为安装服务
remove 为移除服务
可选的service_name是服务的名字，默认为tomcat,这个参数是关键

下面是在另一个tomcatLZZ目录下面做的配置，打开service.bat
rem Guess CATALINA_HOME if not defined
set CURRENT_DIR=%cd%
set CATALINA_HOME=d:\tomcatLZZ
if not "%CATALINA_HOME%" == "" goto gotHome
rem set CATALINA_HOME=%cd%

第三行是关键，直接在这里指定好了，别让系统猜了。
运行安装

D:\tomcatLZZ\bin>service install tomcatLZZ
Installing the service 'tomcatLZZ' ...
Using CATALINA_HOME: d:\tomcatLZZ
Using CATALINA_BASE: d:\tomcatLZZ
Using JAVA_HOME: C:\Program Files\Java\jdk1.6.0_10
Using JVM: C:\Program Files\Java\jdk1.6.0_10\jre\bin\server\jvm.dll
The service 'tomcatLZZ' has been installed.

D:\tomcatLZZ\bin>

安装成功了，系统有了2个tomcat的服务。使用各自的服务和配置